上海工业菌株工程技术研究中心（工业菌株中心）于2013年由上海市科委批准建设。中心的依托单位是复旦大学和上海高科联合生物技术研发有限公司，中心的工程化平台落户在虹口区。工业菌株中心致力于发明自主知识产权的食品级酵母表达系统，以突破生物制造业的核心技术瓶颈；研发新型动物疫苗工业菌株、生物酶工业菌株、抗生素替代品工业菌株，为预防人畜共患疫情、解决饲料短缺和霉菌污染，提升食品安全提供新技术和新产品。