上海工业菌株工程技术研究中心是上海市科委批准的科技成果工程化基地，依托复旦大学在长期基础研究中形成的工业菌株开发的领先核心技术，面向我国饲养领域的重大需求，开发抗生素替代、饲用酶、饲用疫苗专用工业菌株，并形成工艺包，实现向企业的技术推广和生产应用，缓解目前食品安全、人畜共患疫情等带来的危害，提高我国饲养行业的整体水平，提高我国以工业菌株为核心技术的工业蛋白质的国际竞争力。

上海工业菌株工程技术研究中心利用复旦大学长期基础研究形成的工业菌株开发核心技术，紧紧围绕着绿色饲养领域面临的问题，以抗生素替代、提高饲料利用率、提升畜禽免疫力缓解人畜疫情爆发的需求为工业菌株研发的目标，开展工业菌株的研发、工程化过程研究、关键应用技术研究，形成工业菌株的工艺包，实现工业化生产应用；同时，围绕着工业菌株开发共性核心技术，建设一库、两平台、三核心技术，立足上海，面向全国，形成开放的工业菌株研发基地。

上海工业菌株工程技术研究中心  

工程中心行政负责人员

    主任：吕红

    副主任：黄青山，周峻岗

    主任秘书兼信息中心：马骁骁

工程中心管理委员会

工程中心管理委员会是工程中心的最高决策机构，由上海市科委、复旦大学、上海高科联合生物技术研发有限公司相关人员共同组成，负责制定中心的发展规划，设定中心的发展目标，批准中心的实施计划，监督经费使用。中心的运作在管理上采取管理委员会领导下的主任责任制，工程研究中心主任主要负责进行日常工作的管理。

    主任：金力

    副主任：陈杰 

    委员：过浩敏，殷南根，周亚明，李粤江，余青，苟燕楠，陆婉英（高科董事长）

工程中心技术委员会

工程中心技术委员会是中心最高的学术机构。技术委员会设主任1人，副主任2人，委员若干人，聘请国内外知名专家学者、产业界、科技界和依托单位等方面的管理和技术专家。

    主任：杨胜利

    副主任：陈坚（江南大学校长）

    马延和 （863工业生物技术领域专家组长，中科院天津工业生物技术研究所长）

    詹志春（武汉新华扬生物技术股份有限公司，董事长）

    高林（沈阳爱迪生物科技有限公司，总裁/董事长），

    委员：钟扬，马红，卢大儒，黄青山，吕红

    庄英萍（863工业生物技术领域专家，华东理工大学生科院书记）；

    牟伯中（华东理工大学科技处长，生物制造协同创新中心懂事）；

    杜昱光（中科院过程所）

    金城（中科院微生物所）

    石波（农科院饲料所）

工程中心主要研究部门

依据中心的发展定位，设立三大板块，一是技术研发，二是产品开发，三是工程化与推广，同时形成工业菌株开发共性核心技术平台，即：一库（功能基因库）、两平台（工业菌株研发平台和中试平台）、三核心技术（功能基因挖掘技术、高效表达技术和中试放大技术）。

    微生物功能基因资源库：余垚

    建立基于功能筛选和序列筛选并用的高通量筛选技术，重点挖掘各种特殊环境微生物（如深海等）、病原微生物的功能基因，建立功能基因库，为新酶的开发、新型广谱疫苗的开发提供有价值的基因源；

    基因到工业菌株研发平台：季朝能

    重点开展功能基因高效表达技术的研究。建立并完善已有自主知识产权的酵母高效表达系统，实现酵母表达系统对不同外源基因的表达通用性更好、表达量更高；同时研究不同基因高效表达的规律，使其更加适合生产与应用的需求，研发获得具有自主知识产权的工业菌株，突破国外表达系统对我国基因编码产品生产的限制。
    抗生素替代工业菌株研究室：李国栋（高科）

    重点开发以酶、抗菌肽为主的抗生素替代品，通过对其编码基因的改造，获得具有自主知识产权、具有生产和应用价值的工业菌株。
    饲用酶工业菌株研究室：周峻岗

    通过对微生物功能基因库中新型饲用酶基因的评估，重点开发新型饲用酶工业菌株，并建立新型饲用酶协同降解纤维素类饲用原料的应用规律，满足饲用酶生产与应用的需求，提高饲料利用率。

    饲用免疫品工业菌株研究室：顾少华

    基于融合表达线性抗原表位多肽的鉴定，重点研究开发禽流感病毒的广谱疫苗，同时研究开发提高畜禽免疫力的微生物工业菌株。

    中试放大平台：黄青山

    利用已有的中试放大平台，研究建立抗生素替代、新型饲用酶、免疫增强调节微生物等工业菌株相对应的中试工艺。

    技术转移与应用推广室：田国樑

    在工业菌株及中试工艺的基础上，构建工业菌株的工艺包，与信息中心紧密结合，面向相关企业进行工业菌株工艺包的生产技术推广与转移，推动相关企业产品的更新换代；同时，负责工业菌株核心技术平台对外开放与共享，形成对生物制造业的服务能力。